پژوهشکدۀ فلسفه و کلام اسلامی در بیش از دو دهه از فعالیت خود در راستای معرفی و تبیین آموزه‌های نظری اسلام، تعمیق و تحکیم باورهای دینی، بازشناسی و توانمندسازی میراث فلسفی و کلامی و در‌نهایت ترسیم مبانی عقلی و چارچوب‌های تحلیلی حوزۀ اخلاق گام‌های مهمی برداشته است. از‌این‌رو بازنگریِ اندیشه‌های فلسفی و کلامی و بسط و توسعه این میراث قویم و ماندگار از یک‌سو و پایش چالش‌ها، مسائل و نیازهای معرفتی جامعۀ کنونی را از سوی دیگر وجهۀ همت خود ساخته است.
این پژوهشکده علاوه بر تألیف بیش از صد کتاب و مدیریت کلان‌پروژه‌های تأثیر‌گذار، بخشی از همت خود را صرف برگزاری کرسی‌های نظریه‌پردازی و نشست‌های علمی کرده است تا ضمن ورود به عرصه‌های جدید، مدخلی به سوی نظریه‌پردازی و برگزاری کرسی‌های تخصصی بگشاید و با ایجاد نشاط علمی در کاوش و جستارگشایی موضوعات نوین، رفع شبهات اعتقادی و بارور‌ساختن شاخه‌های جدید علمی پیش‌قدم باشد.